De Israëlische krant Haaretz stelde dat het voor het eerst is dat de Joodse staat instemt met een een VN-onderzoek naar een zaak waarbij Israëlische militairen zijn betrokken. Het onderzoekspanel telt vier leden, onder wie een Turks en een Israëlisch lid. Het team, dat onder leiding staat van de Nieuw-Zeelandse ex-premier Geoffrey Palmer en de vertrekkende Colombiaanse president Alvaro Uribe, begint op 10 augustus aan zijn klus en moet zijn eerste voortgangsrapport halverwege september indienen.

Topambtenaren in het kabinet van de Israëlische premier Benjamin Netanyahu stemden ermee in „het onderzoekspanel toegang te geven tot gegevens” van twee Israëlische commissies die afzonderlijke onderzoeken hebben verricht naar het incident van 31 mei. Ook Turkije heeft onderzoek naar de bestorming van de vloot met hulpgoederen gedaan.

Israël heeft zich lang verzet tegen een onafhankelijk onderzoek naar de kwestie. Wegens de grote internationale druk zou de regering van Netanyahu zijn gezwicht. Over het precieze mandaat van het VN-team wordt nog onderhandeld.

Turkije en Israël zijn oude bondgenoten, maar de relatie is onder druk komen te staan door de aanval op het konvooi en andere incidenten.

De VN hadden ook twee voormalige hoge functionarissen van internationale hoven in Den Haag gevraagd voor het onderzoek. Oud-presidente Rosalyn Higgins van het Internationaal Gerechtshof en oud-president Philippe Kirsch van het Internationaal Strafhof hebben echter bedankt voor de eer, zo heeft het ANP in welingelichte kringen vernomen.