De school begon in 1984 met een aantal kleine vestigingen die verspreid waren over Apeldoorn. Er waren destijds niet meer dan 204 leerlingen. Zij hadden de keuze uit mavo en havo. Tegenwoor-dig biedt de Jacobus Fruytier onderwijs aan van vmbo tot lyceum.In 1992 werd de hoofdvestiging aan de Anklaarseweg in Apeldoorn in gebruik genomen.

Inmiddels zit de scholengemeenschap in drie plaatsen. Naast Apeldoorn zijn dat Rijssen en Uddel. In Apeldoorn heeft de school een hoofdvestiging en een nevenvestiging.

Er volgen nu ruim 2840 leerlingen de lessen aan de scholengemeenschap.