Silaen zou niets hebben gedaan om te voorkomen dat op 6 april 1999 katholieke kerken in Liquica en Suai in brand werden gestoken. Daardoor kwamen zeker veertig mensen die daar hun toevlucht hadden gezocht om het leven. Ook zou hij betrokken zijn geweest bij aanslagen op gebouwen op 5 september 1999, kort na het referendum waarin de Oost-Timorezen zich voor onafhankelijkheid uitspraken.

Woensdag werd oud-gouverneur Abilio Soares van Oost-Timor veroordeeld tot drie jaar gevangenisstraf. Hij werd schuldig bevonden aan misdaden tegen de menselijkheid bij de gewelddadigheden in 1999 in de vroegere Portugese kolonie. Behalve Soares en Silaen staan nog zestien politiefunctionarissen en militairen in de beklaagdenbank wegens hun rol bij de gewelddadigheden.