De rechters achtten bewezen dat de 66–jarige Indonesiër betrokken was bij de aanslagen op Bali in oktober 2002. Daardoor kwamen ruim tweehonderd mensen om het leven, onder wie vijf Nederlanders.

Bahir stond ook terecht voor de aanslag op het JW Marriot Hotel in Jakarta, die in augustus 2003 twaalf mensenlevens eiste. De rechters vonden daar echter onvoldoende bewijzen voor.

Aanklagers hadden op 8 februari acht jaar geëist tegen Bashir wegens diverse terreurdaden. Volgens westerse regeringen is hij het hoofd van het Zuidoost–Aziatische terreurnetwerk Jemaah Islamiya. Bashir is echter van terrorisme vrijgesproken.