Bush volgt de aanbevelingen van de commissie overigens maar ten dele. De nieuwe inlichtingendirecteur krijgt geen rang op kabinetsniveau. Hij krijgt ook geen zeggenschap over de begrotingen van de zestien inlichtingendiensten. Hij heeft een coördinerende functie wat het verzamelen en analyseren van inlichtingen betreft, maar hij krijgt geen operationele bevoegdheden. Die blijven bij de afzonderlijke diensten.

Voorzitter Thomas Kean en vice-voorzitter Lee Hamilton van de onafhankelijke commissie noemden Bush’ beslissing „een belangrijke stap”, maar zij spraken niet hun volledige steun uit voor het besluit.

Volgens het rapport van de commissie is er behoefte aan een nieuwe inlichtingenchef met vergaande bevoegdheden en niet aan een nieuwe coördinator die de bureaucratie alleen maar ingewikkelder maakt. „Bush geeft de indruk dat hij de aanbevelingen van de commissie volgt, maar in feite blijven de verantwoordelijkheden ongewijzigd. Het enige wat verandert is het feit dat de nieuwe inlichtingendirecteur voortaan de belangrijkste adviseur wordt van de president in plaats van de directeur van de inlichtingendienst CIA, die tot nu toe beide functies vervulde”, aldus Stanley Kober, politiek analist van het Cato Research Institute in Washington.

Bush’ Democratische rivaal in de presidentsverkiezingen senator John Kerry beschuldigde de president ervan veel te traag te reageren op het rapport van de commissie. „De president moet het parlement van zomerreces terugroepen om de aanbevelingen van de commissie uitgebreid te bespreken en vervolgens spijkers met koppen te slaan. Dat wordt nu onnodig uitgesteld, zodat de noodzakelijke hervormingen niet op de kortst mogelijke termijn gerealiseerd kunnen worden”, aldus Kerry maandag. Het Witte Huis verwierp de suggestie om het parlement terug te roepen.

Volgens Kerry moeten de aanbevelingen van de onafhankelijke commissie niet selectief en ten dele worden overgenomen, maar moet men integraal uitvoeren wat de commissie voorstelt. Kerry pleitte verder voor een herziening van Amerika’s buitenlandse en antiterrorismebeleid, „omdat dit beleid ons alleen maar meer vijanden bezorgt en de terreur tegen Amerika en zijn bondgenoten bevordert.” President Bush wees deze beschuldiging maandag als „belachelijk” van de hand.

In New York, Newark en Washington werden intussen uitgebreide maatregelen genomen om terreuraanslagen te voorkomen. De overheid waarschuwde het afgelopen weekeinde voor mogelijke acties tegen verschillende belangrijke financiële instellingen en tegen het VN-hoofdkwartier in New York. Rond de desbetreffende gebouwen werd het vrachtverkeer gecontroleerd, omdat men vreest voor aanslagen met autobommen. Ook het personeel van de bewuste organisaties werd aan uitgebreide controles onderworpen. „Wij zullen kosten noch moeite sparen om de organisaties te beschermen die van groot belang zijn voor onze stad en die van vitaal belang zijn voor onze economie”, aldus burgemeester Michael Bloomberg van New York maandag.