Voor de toekomst van Joon liggen verschillende opties op tafel. Een definitieve beslissing zou door de leiding van de luchtvaartonderneming nog niet zijn genomen. Eerder deden berichten de ronde dat Smith, die recent aan het roer kwam te staan bij Air France-KLM, de stekker uit Joon wilde trekken. Dat was tegen het zere been van bonden die bij een dergelijke stap een forse schadevergoeding eisen.

Joon werkt met goedkoper cabinepersoneel en bespaart verder op de kosten door een relatief kleine en eenvoudige organisatie. De budgetdochter is onder meer bedoeld om de concurrentieslag op lange vluchten aan te gaan met Golfmaatschappijen als Emirates en Qatar Airways.