Vanaf 1835 kwamen daar op het landgoed van jonkheer Willem Versluijs afgescheidenen samen uit de dorpen Domburg, Aagtekerke, Meliskerke en Grijpskerke. Op 28 augustus 1836 is er een gemeente ontstaan. Ds. H. J. Budding preekte die dag over Hebreeën 10:19-23. In een kerkdienst van de gereformeerde gemeente van Aagtekerke is hier recent bij stilgestaan.

Sint Jan ten Heere ligt op ongeveer twee kilometer afstand van het Walcherse Aagtekerke. Het gehucht toont geen herinneringen meer aan het landgoed van Versluijs. Na de dood van Versluijs in 1875 werd het landgoed opgekocht door de burgemeester van Aagtekerke, die er een boerderij liet neerzetten.

Aan de Prelaatweg is daarna in 1876 als vervanging van de preekplaats een kerkgebouw verrezen, bekostigd uit een legaat van Versluijs. Dat meldt Kees-Jan Meeuse, kenner van de geschiedenis van het kerkelijk leven in Sint Jan ten Heere.