Het systeem voldoet volgens het ministerie aan de hoogste veiligheidseisen. Artsen kunnen zelfs uit hun ambt worden gezet als ze misbruik maken van de vertrouwelijke gegevens waarover ze beschikken. Patiënten mogen hun dossier inzien wanneer ze willen. Ze kunnen weigeren de artsen en apothekers toegang te geven tot hun gegevens. Het ministerie van Volksgezondheid verwacht niet dat veel mensen bezwaar zullen maken.Het ministerie van Volksgezondheid werkt al vele jaren aan de voorbereiding van het centrale medische dossier. Deskundigen verwachten dat veel medische fouten kunnen worden voorkomen omdat er veel meer kennis over de patiënt beschikbaar komt. Artsen weten nu bijvoorbeeld vaak niet welke medicijnen een patiënt slikt, omdat veel mensen diverse artsen bezoeken en niemand overzicht heeft. Ook kan dubbelwerk beter worden voorkomen. Patiënten hoeven bovendien niet steeds opnieuw hun verhaal te doen.

Artsen waren in het verleden tegen invoering van het centrale systeem. De Tweede Kamer heeft daarom besloten dat ze verplicht moeten meedoen aan het nieuwe elektronisch patiëntendossier. Ze kunnen, net als de apothekers, susbidies krijgen om de invoering te vergemakkelijken.

De (huis)artsen en apothekers moeten zich eind volgend jaar hebben aangemeld. Daarna kan worden besloten dat meer zorginstellingen gebruik moeten maken van het systeem. In een aantal regio’s werken de artsen al langer met de elektronische dossiers.