De zaak werd voor de tweede keer behandeld door de politierechter in Assen. In maart 2004 verklaarde deze het OM niet–ontvankelijk omdat niet de Drentse commissaris van de koningin Ter Beek aangifte had moeten doen, maar Pannekoek zelf. Het hof oordeelde in hoger beroep anders en verwees de zaak in maart dit jaar terug naar Assen.

In tegenstelling tot vorig jaar werd de zaak donderdag wel inhoudelijk behandeld en kreeg Kloos de gelegenheid zich te verweren. Zijn raadsman H. Anker deed onder meer een beroep op gewetensdrang. Kloos vond dat er sprake was van misbruik van de vertrouwenscommissie voor een deal met de burgemeester. Hij vond de plicht om dit aan de kaak te stellen zwaarder wegen dan de geheimhoudingsplicht.