Pollycarpus, die als passagier meevloog in het toestel waarmee Munir in 2004 van Jakarta naar Amsterdam reisde, werd tot veertien jaar veroordeeld wegens toediening van een fatale dosis arsenicum in het eten van Munir. Rechter Iskandar Kamil zei echter dat de openbaar aanklagers geen getuige hebben gevonden die gezien heeft dat Pollycarpus het gif in het eten van Munir had gedaan.Aanhangers van Munir hebben steeds beweerd dat Pollycarpus als zondebok fungeerde en dat in werkelijkheid hooggeplaatste figuren binnen de Indonesische inlichtingendienst achter de moord zitten. Ook een onafhankelijke onderzoekscommissie zei eerder dit jaar dat de inlichtingendienst mogelijk bij de moord op de mensenrechtenactivist betrokken is geweest. De rechter in het proces zei echter niet of Pollycarpus in opdracht van derden heeft gehandeld.

Overigens blijft de twee jaar cel wegens documentenvervalsing waartoe Munir is veroordeeld, gehandhaafd, meldde Antara.

Munir oefende al onder het regime van dictator Suharto openlijk en veelvuldig kritiek op het Indonesische leger. Zo beschuldigde hij leden van de strijdkrachten onder meer van mensenrechtenschendingen in Oost-Timor, Atjeh en West-Papoea, en betrokkenheid bij illegale houtkap en drugssmokkel. Andere landen volgden de rechtszaak tegen Pollycarpus met belangstelling, omdat eruit zou kunnen blijken of de regering van president Susilo Bambang Yudhoyono werkelijk heeft gebroken met het verleden, toen moorden in opdracht van de staat niets bijzonders waren en de rechterlijke macht een instrument was van de regerende elite.

Munirs weduwe, Suciwati Thalib, zei na de uitspraak van de rechtbank dat er weinig veranderd is. Suciwati heeft zich onvermoeibaar ingezet voor de vervolging van de plegers van de moord op haar echtgenoot. De rechter merkte weliswaar op dat Pollycarpus in de periode voor de moord vaak was gebeld door het nummer van een hoge inlichtingenfunctionaris, maar hij ging daar verder niet op in.