De kerk werd in september 2018 grotendeels door een uitslaande brand verwoest. Daarbij werden het schip en het priesterkoor zwaar beschadigd, maar de 65 meter hoge toren bleef gespaard. Inmiddels is de Urbanuskerk nagenoeg geheel in vier fases herbouwd en gerestaureerd. Naar verwachting zal de bisschop op 16 april 2023 de kerk weer kunnen inwijden.

De Urbanuskerk wordt nog voorzien van het interieur uit de St.-Werenfriduskerk in Workum. In de Werenfriduskerk wordt een zorgcentrum voor dementerende ouderen gerealiseerd.

De driebeukige neogotische Urbanuskerk in Bovenkerk dateert uit 1888, is een rijksmonument en werd ontworpen door de beroemde architect Pierre Cuypers. De kerk is in gebruik bij de parochie Amstelland.