De onderzoeken werden betaald door de Nationaal Coördinator Terrorismebestrijding en Veiligheid (NCTV). Die droeg ook het bureau NTA aan voor het onderzoek, aldus NRC.

Huizen, Hilversum en Gooise Meren melden dat NTA „in opdracht van de gemeenten op een verantwoorde manier de netwerken binnen de islamitische gemeenschap in kaart heeft gebracht” en dat daar aanleiding voor was. De gemeenten stellen dat onderzoek werd verricht in een periode waarin er veel aandacht was voor terrorisme en radicalisering. „NTA heeft ons verzekerd géén heimelijke bezoeken gebracht te hebben aan de moskeeën en dat de personen die geïnterviewd zijn, wisten dat zij meewerkten aan een onderzoek voor de gemeente. Van infiltratie, zoals door NRC gesuggereerd wordt, is geen sprake”, aldus de drie gemeenten.

De gemeente Ede liet in een verklaring weten dat er tot het verschijnen van het artikel in NRC nooit signalen zijn geweest van een undercoveroperatie door NTA in de moskee in die gemeente. Ede wist wel dat er onderzoek werd gedaan, maar daarvoor zouden interviews worden gemaakt met betrokkenen binnen de islamitische gemeenschap. De onderzoekers zouden zich aan die betrokkenen bekendmaken, dacht de gemeente. Wat er precies is gebeurd gaat de gemeente uitzoeken.

Ook Ede had aanleiding om meer zicht te krijgen op polarisering en radicalisering op lokaal niveau. De gemeente had daarvoor zelf de expertise niet in huis en vroeg NTA om onderzoek te doen. De gemeente heeft zondag al met de islamitische gemeenschap gesproken. „We begrijpen dat ze het rapport zien als inbreuk op hun privacy. We nemen de zorgen en vragen uiterst serieus”, aldus de verklaring van de gemeente.