Volgens rechter Kardijo Alkusar voerde Soares bij de behandeling van zijn hoger beroep aan in 1999 het Indonesische leger de touwtjes in de voormalige Portugese kolonie in handen had. Hijzelf zou als civiel bestuurder niet verantwoordelijk kunnen worden gesteld voor de veiligheid.

Zijn verzoek om vrijspraak is toegewezen, liet de rechter weten. Hij wordt direct vrijgelaten. Hoewel hij al in 2002 is veroordeeld, zat hij volgens de media nog maar net in de gevangenis.

De Verenigde Naties schatten dat het geweld in 1999 ongeveer duizend mensen het leven heeft gekost. Door het Indonesische leger gesteunde milities richtten een bloedbad aan, nadat de bevolking van het gebied in een referendum voor onafhankelijkheid had gekozen. Oost-Timor kwam in mei 2002 op eigen benen te staan. Jakarta heeft een speciaal tribunaal opgezet om de schuldigen te berechten.

Van de achttien verdachten die sindsdien voor dat tribunaal zijn verschenen, zit er echter nog maar een vast, de gevreesde militieleider Eurico Guterres, die tot vijf jaar is veroordeeld. Alle andere verdachten zijn vrijgesproken of wisten hun veroordeling met succes in hoger beroep aan te vechten.

Mensenrechtenorganisaties hebben woedend gereageerd op de vrijspraak van Soares. Volgens hen bewijst de uitspraak van het Indonesische hof eens te meer dat het mensenrechtentribunaal voor Oost-Timor niet meer dan een schijnvertoning is.