Bij zeven van de 155 instellingen was het onderzoek echter nog niet voltooid. Dat was een gevolg van de complexiteit en tegenwerking van de instellingen. Schutte concludeerde dat instellingen voor hoger beroepsonderwijs, middelbaar beroepsonderwijs en universiteiten in de periode 1998–2002 58 miljoen euro ten onrechte hadden ontvangen. Het kabinet is tevreden met het werk van de commissie, die in tien maanden een maximale prestatie heeft geleverd.

Staatssecretaris Nijs (Onderwijs) zal per instelling een terugvorderingsbesluit maken. Het geld dat wordt teruggevorderd, zal ten goede komen aan de algemene middelen. Afhankelijk van de aard en omvang van het terug te vorderen bedrag, kunnen aanvullende maatregelen worden genomen tegen een instelling. In het geval van administratieve fouten zal bij kleine bedragen niet worden teruggevorderd.