In augustus 2003, bij de presentatie van het jaarverslag september 2002-september 2003, bleek de financiële basis van de vereniging in gevaar te zijn. De opbrengsten uit collecten waren teruggelopen. Ook het aantal leden en donateurs was verminderd, van 1251 naar 1161. Meer dan de helft van de donateurs had de laatste twee jaar geen bijdrage overgemaakt. De vereniging kampte op dat moment met een tekort op haar begroting van 45.000 euro. De financiële tekorten in 2001 en 2002 bedroegen respectievelijk 169.000 en 199.000 euro. Gevreesd werd dat de dienstverlening en de uitstraling van de vereniging op het spel zouden komen te staan.

Geert van Dartel, secretaris van de vereniging, zei vrijdag desgevraagd dat de jaarcijfers van 2003 weer een positief beeld laten zien. „Door enkele eenmalige meevallers en een gedeeltelijk herstel van de waarde van de belegde reserve komt de jaarrekening uit op een positief resultaat van 27.000 euro.”

De Katholieke Vereniging voor Oecumene heeft als doel het dienen van de Rooms-Katholieke Kerk in Nederland „in haar streven naar volledige gemeenschap tussen de Rooms-Katholieke Kerk enerzijds en de kerken van het Westen en de Oosterse Kerken anderzijds.” De vereniging ontstond in 2001 uit een fusie van het Apostolaat voor de Oosterse Kerken (opgericht in 1927) en de Sint Willibrordvereniging (1948).