Niënhaus werd geboren op 9 september 1929 in het Gelderse plaatsje Gendt. Hij ging als geestelijke aan de slag in 1955 en in de jaren 80 werd de geestelijke hulpbisschop bij het aartsbisdom Utrecht. Hij was daarmee de tweede man binnen het aartsbisdom. Hij was onder meer verantwoordelijk voor onderwijs, jongeren en vorming namens de bisschoppenconferentie.

Het schoolbestuur Mgr. Niënhausstichting wijzigde twee jaar geleden zijn naam naar Fidarda, vanwege klachten over het gedrag van de bisschop. Indertijd sprak de stichting in een biografie op de website over „de bezieling van de bisschop, aanstekelijk voor andere mensen omdat hij hen op een open, uitnodigende wijze tegemoet trad. Niënhaus was geen man van grote theologische woorden, maar van verhalen waaruit een grote evangelische wijsheid sprak. Hij sprak de taal van het hart. Daardoor wist hij mensen te raken, zoals hij zich op zijn beurt liet raken door het leven van andere mensen.”

In 1999 nam hij afscheid van de kerk vanwege problemen met zijn gezondheid. Niënhaus overleed op 5 december 2000.