De lichamen van de kinderen werden 2 weken na hun vermissing gevonden in een duiker in een sloot in Cothen. De stoffelijke overschotten waren in erbarmelijke toestand doordat de lichamen lang in het water hadden gelegen. Dat maakte onderzoek naar de doodsoorzaak erg ingewikkeld.

Het Nederlands Forensisch Instituut (NFI) heeft sectie op de lichamen verricht en toxicologisch onderzoek gedaan. Buitenlandse experts zijn geraadpleegd. De plaats waar de dode kinderen werden gevonden, is minutieus uitgekamd. Er is echter geen afdoende antwoord gevonden op de vraag hoe de kinderen zijn gestorven en waar ze zijn gedood. De 38-jarige vader maakte een dag nadat hij zijn zoontjes had opgehaald, een eind aan zijn leven in een bos bij Doorn.

Er is ook onderzoek gedaan naar de psychische toestand van de vader door het Nederlands Instituut voor Forensische Psychiatrie en Psychologie (NIFP). Mogelijk leed de man aan een stoornis waardoor hij tot zijn daad kwam. Maar daarover kan op basis van de beschikbare informatie niets gezegd worden volgens het OM. Er was veel informatie over de vader beschikbaar, omdat hij en zijn ex-vrouw al jaren ruzie hadden over de kinderen, waarbij tal van hulpverleners waren betrokken.

Ruben (9) en Julian (7) werden voor het laatst levend gezien op de achterbank van de auto van hun vader in het Zuid-Limburgse Neerbeek. De vader had gezegd dat hij een paar dagen op vakantie zou gaan met zijn kinderen, maar heeft in plaats daarvan een soort afscheidsrit door Nederland gemaakt, zo is gebleken uit speurwerk na de vermissing van de kinderen. De auto van de vader is na Neerbeek nog op camerabeelden in Rhenen en Wijk bij Duurstede gezien, maar onduidelijk is gebleven of de kinderen toen nog leefden. De vader had zijn daad wekenlang voorbereid.