Volgens rechter Leonie Brinkema maakt Moussaoui, de enige verdachte die tot nog toe in de VS is aangeklaagd in verband met de aanslagen in New York en Washington, zich continu schuldig aan beledigingen en dient hij de ene kansloze motie na de andere in. Brinkema heeft de door de rechtbank aan Moussaoui toegewezen advocaten de opdracht gegeven zijn verdediging te voeren in het vervolg van het proces. De advocaten werden eerder door de Fransman van Marokkaanse afkomt op non-actief gesteld.

Moussaoui wordt vaak de ”twintigste kaper” genoemd, omdat hij in het vliegtuig zou hebben moeten zitten dat in Pennsylvania neerstortte na verzet van passagiers en waarmee volgens het OM een aanslag op het Witte Huis zou worden gepleegd. Als Moussaoui schuldig wordt bevonden aan lidmaatschap van een terreurorganisatie en als bewezen wordt verklaard dat hij heeft deelgenomen aan de voorbereiding van de aanslagen op New York en Washington, kan hij ter dood veroordeeld worden.

Moussaoui werd in augustus 2001 aangehouden wegens overtreding van de immigratieregels en zat op de dag van de aanslagen in voorlopige hechtenis. Hij heeft bekend lid te zijn van het terreurnetwerk van Osama bin Laden. Veel waarnemers van het proces twijfelen aan de geestelijke gesteldheid van Moussaoui, die een instabiele indruk zou maken.