De vieringen in de parochies op de zogeheten Willibrordzondag staan in het teken van de oecumene, het streven naar eenheid van de kerken. „Geef dat de verschillende tradities die, geënt op Uw Woord, breuken uit het verleden te boven willen komen, elkaar niet forceren, maar elkaar in hechte gemeenschap verstaan en vernieuwen”, aldus het gebed voor de protestantse kerkfusie dat de Katholieke Vereniging voor Oecumene de parochies aanbeveelt. „Geef, Heer, dat deze mijlpaal op de pelgrimstocht naar de eenheid van uw Kerk de oecumenische beweging in ons land opnieuw inspireert en moed geeft.”

De RK-Kerk in Nederland stelde de jaarlijkse Willibrordzondag in 1949 in om het werk voor de eenheid van de kerken van de Katholieke Vereniging voor Oecumene, voorheen de Willibrordvereniging, te ondersteunen.