Sinds de militaire staatsgreep van 3 juli onderdrukken de nieuwe machthebbers de MB in toenemende mate. Talrijke Moslimbroeders zijn gevangen gezet en honderden gedood bij het neerslaan van protesten. De MB-aanhangers protesteren al weken tegen het leger en de interim-regering en voor de terugkeer van de democratisch gekozen president Mohamed Mursi. Die komt voort uit de MB.

Van hem is sinds 3 juli niets meer vernomen. Onder de gevangen zittende Moslimsbroeders zijn het hoofd van de politieke partij van de MB, Saad al-Katatni, de voormalige Gids van de beweging, Mahdi Akef, en de invloedrijke financier en organisator Khairat al-Shater.

De in 1928 opgerichte broederschap wordt al heel lang vervolgd door machthebbers. De golven van onderdrukking hebben de van huis uit sektarische beweging een geheimzinnig karakter bezorgd. Er zijn verschillende vormen van lidmaatschap en het ledental is niet bekend. Bij de parlementsverkiezingen van 2011 en 2012 behaalde de beweging 37,5 procent van de stemmen en in de eerste ronde van de presidentsverkiezigingen in 2012 25 procent. Mursi won in de tweede ronde, maar ook met steun van veel kiezers die in de eerste plaats tegen zijn rivaal waren, een ex-premier van Mubarak.

Een provinciale onderwijzer en geen geestelijke, Hassan al-Banna (1906-1949), heeft de MB in 1928 opgericht. Hij wilde het volk sociaal en moreel opvoeden en de Britse en westerse invloed stuiten. Hij was een van de eerste activisten in het moderne Midden-Oosten die de massa overtuigden van de islam als politieke kracht.