Perisic werd in 2011 in eerste aanleg tot 27 jaar cel veroordeeld. Een meerderheid van de rechters hield hem medeverantwoordelijk voor het doden van duizenden Bosnische moslimburgers, onder meer na de val van Srebrenica. Het Bosnisch-Servische leger van generaal Mladic pleegde die misdaden met wapens die het van Perisic had gekregen.

Twee van de drie rechters vonden destijds dat Perisic voor het helpen bij die misdaden moest worden veroordeeld. Voorzittend rechter Moloto was het daar niet mee eens. Hij zag onvoldoende verband tussen Perisic en de misdaden en bepleitte daarom vrijspraak. De Perisic-zaak is de eerste waarin de Kamer van Beroep van het tribunaal vonnist over het verband tussen Srebrenica en de leiding in Belgrado.