Brein ronde in totaal 651 onderzoeken af. De sites die op basis hiervan van het net werden gehaald waren vooral zogeheten file-sharingsites, die toegang gaven tot illegale bestanden. De meeste hiervan werden door de providers zelf verwijderd.

Stichting Brein bestrijdt intellectuele eigendomsfraude namens auteurs, kunstenaars en producenten van bijvoorbeeld muziek, films en software. In 2011 deed Brein 742 onderzoeken. Toen werden door ingrijpen van de stichting 608 sites gesloten.