De scheepvaart door het kanaal vervoerde bijna 334 miljoen ton vracht in het boekjaar dat eind september afliep, tegen 322 miljoen ton een jaar eerder. De meeste vracht (144 miljoen ton) ging naar de Verenigde Staten of was afkomstig uit de VS. China nam de tweede plaats in met 53 miljoen ton, gevolgd door Chili (28 miljoen ton) en Japan (22 miljoen ton). Andere belangrijke gebruikers van het Panamakanaal zijn Peru, Colombia, Ecuador, Mexico, Venezuela en Panama zelf.

Het Panamakanaal ondergaat momenteel een uitbreiding van 5,6 miljard dollar waardoor veel grotere containerschepen door het 80 kilometer lange kanaal kunnen. Die expansie moet eind 2014 zijn afgerond. Sinds de opening in 1914 hebben meer dan een miljoen schepen de waterweg gepasseerd. Ongeveer 5 procent van de wereldwijde handel gaat via het Panamakanaal.