Het Friese museum kreeg met 34,3 procent de meeste stemmen van het publiek. In totaal brachten ruim 41.000 mensen een stem uit op een van de vier genomineerde musea. Naast Natuurmuseum Fryslan maakten Het Scheepvaartmuseum in Amsterdam, Naturalis in Leiden en het Kinderboekenmuseum in Den Haag kans op de Museumprijs.

Een vakjury selecteerde de vier instellingen uit 45 aanmeldingen. Elk jaar is er een andere categorie waar de musea aan moeten voldoen. Dit jaar koos de jury voor musea „die zich het meest effectief en aansprekend richten op kinderen van 4 tot 12 jaar oud.” Na de selectie van de genomineerden kon het publiek via internet zijn stem uitbrengen.

Over Natuurmuseum Fryslan zei de jury onder de indruk te zijn „van het gastvrije karakter, de kindvriendelijkheid en de doeltreffende presentatie.” Het museum is al in 1923 ontstaan. Enkele Leeuwarder natuurliefhebbers staken de koppen bij elkaar en besloten dat er in de hoofdstad van Friesland een natuurmuseum moest komen.

De Museumprijs, die bestaat sinds 1990, geldt als de meest prestigieuze publieksprijs in de Nederlandse museumwereld. De vorige winnaar in 2010 was Museum Boijmans Van Beuningen in Rotterdam.