Volgens de aanklagers beraamde Dogan met een groep militairen bomaanslagen op onder andere grote moskeeën in Istanbul, om het land te destabiliseren en rijp te maken voor een staatsgreep. Het proces in de zaak, Balyoz (voorhamer) genoemd, ging in december van start. Veel van de in totaal 196 verdachten zaten al vast.

De zaak doet in Turkije veel stof opwaaien. Zo wordt de authenticiteit van het bewijsmateriaal in twijfel getrokken. Het proces zou een poging van de partij AKP van premier Recep Tayyip Erdogan zijn om het seculiere leger in diskrediet te brengen. Seculieren beschuldigen de partij van een heimelijke islamistische agenda.