De nieuwe functie van de synagoge maakt deel uit van een omvangrijk plan, waarbij diverse kerkgebouwen in het centrum een nieuwe functie krijgen. Als gevolg van de fusie van de hervormde gemeente en de gereformeerde kerk kwam de gereformeerde kerk leeg te staan. De protestantse gemeente ging kerken in de Nicolaikerk. De gereformeerde kerk vrijgemaakt kocht de gereformeerde kerk aan.

De synagoge aan de Broerstraat dateert uit 1801 en verving een huissynagoge aan de Dijkstraat.

In augustus 1942 zijn vrijwel alle Joden in Appingedam, samen met de andere Joodse inwoners van de provincie Groningen, gedeporteerd. Van hen heeft slechts een zestal de oorlog overleefd.

Na de oorlog is de synagoge, die in mei 1945 door een bom werd getroffen, verkocht. Sinds 1985 staat voor de voormalige synagoge een gedenkteken met de namen van de omgekomen Joodse bewoners van Appingedam.