Het Studiecentrum Islam en Samenleving in Jakarta vond een „zorgwekkende toename” van religieuze intolerantie onder moslims in 2010 vergeleken met 2001. Leider Jajat Burhanudin van het studiecentrum zei dat bepaalde ministers de intolerantie actief aanmoedigen. De politie beschermt minderheden te vaak niet.

Voor het onderzoek waren 1200 volwassen moslimmannen en -vrouwen in Indonesië ondervraagd. Van hen zei 57,8 procent tegen de bouw van kerken en andere niet-islamitische gebedshuizen te zijn. Dat is het hoogste percentage sinds 2001. Meer dan een kwart (27,6 procent) heeft er bezwaar tegen als niet-moslims hun kinderen opvoeden. Dat was 21,4 procent in 2008.