De Commissie MER, een onafhankelijke groep van deskundigen, was gevraagd om een voorlopig rapport waarin de effecten van de bypass op het milieu worden beschreven, te toetsen. Volgens de deskundigen geeft het rapport geen antwoord op de cruciale vraag of alleen verlaging van het zomerbed in de IJssel volstaat om op korte termijn een benodigde verlaging van de waterstand te bereiken. De zijtak van de rivier zal worden aangelegd om in de toekomst watersnood in de omgeving van Kampen te voorkomen.

De conclusie is opvallend, omdat onder andere de provincie Overijssel, waterschap Groot Salland en de gemeente Kampen de bypass wel snel willen aanleggen. De snelle aanleg kan dan gecombineerd worden met het verdiepen van de vaargeul in de IJssel, waardoor kosten bespaard kunnen worden. De deskundigen vragen zich echter af of er wel zo veel te winnen valt. De Commissie MER verwijst naar het advies van de Deltacommissie om in de toekomst het IJsselmeerpeil met 1,5 meter te verhogen. Als dat gebeurt, heeft dat gevolgen voor de bypass. „Ten tweede is het de vraag of de aanzienlijke milieugevolgen van de aanleg van de bypass opwegen tegen efficiëntievoordelen in de grondverwerking”, aldus de commissie.

Volgens Marcel van Dijk, woordvoerder van Projectbureau IJsseldelta-Zuid waarin de regionale overheden vertegenwoordigd zijn, was al bekend dat tot 2015 de zomerbedverlaging voldoende is om de veiligheid te waarborgen. „Dat jaar zal ook een besluit genomen worden voor een nieuw peil in het IJsselmeer. De gevolgen van dat besluit kunnen dus verwerkt worden in de kunstwerken die in de bypass gebouwd worden.” In 2020 zouden de sluizen dan voltooid moeten zijn. Daarmee is de bypass altijd berekend op een toekomstige situatie. De dijken die rondom de bypass worden gelegd, zullen ook hoog genoeg zijn, aldus Van Dijk.