Dr. Noort is nu werkzaam als docent missiologie aan het Hendrik Kraemer Instituut, het kenniscentrum van de Protestantse Kerk (PKN), dat opleidingen verzorgt op het gebied van zending en ontwikkelingssamenwerking. Daarnaast is hij verbonden aan het bureau kerkelijk werkers van het Landelijk Dienstencentrum van de PKN. Hij zal op 1 oktober in dienst treden van de Nederlandse Zendingsraad, waar hij nog enkele maanden met Wout van Laar zal samenwerken. Van Laar gaat met emeritaat.

Gert Noort heeft ervaring in het missionaire werk, in binnen- en buitenland. Tussen 1991 en 1995 werkte hij als docent aan de theologische hogeschool GKST te Sulawesi, Indonesië. Daarna was hij werkzaam bij de Raad voor de Zending te Oegstgeest en bij Kerk in Actie, de diaconale organisatie van de PKN.

Dr. Noort promoveerde in 2006 op een dissertatie over het leven en werk van zendeling Albert Kruyt, van 1892 tot 1932 zendeling in Midden-Celebes.