Vanuit het stadhuis op nauwelijks 500 meter van het World Trade Center spoedde Giuliani zich op 11 september naar de plaats des onheils toen zich daar twee gekaapte vliegtuigen in beide WTC-torens hadden geboord. Hij werd er zelf nog maar net tijdig verwijderd door enkele politiemensen, voordat het deel van het complex waar hij zich bevond instortte.

Na de ramp was Giuliani overal. Hij organiseerde hulpoperaties, hij was open en duidelijk over de stand van zaken en stond de slachtoffers waar mogelijk persoonlijk bij. „Hij was er voor iedereen, hij gaf niet op en hij schrok niet terug voor de emotionele pijn om zich heen”, aldus Time. Giuliani zei vereerd te zijn met de uitverkiezing, die volgens hem heel New York geldt. „Ik denk dat niet ik ben geselecteerd, maar alle New Yorkers als ’bevolking van het jaar’”, aldus Giuliani.

De burgemeester stapt na 31 december op, aan het eind van twee ambtstermijnen. Hij laat een veiliger stad achter omdat hij zich jarenlang met succes heeft ingespannen om de misdaad concreet te bestrijden. Niet al zijn campagnes liepen succesvol af. Zijn pogingen om de sexindustrie uit de stad te bannen slaagden slechts gedeeltelijk en zijn pogingen om iets te doen aan de ongeregelde jungle van New Yorks taxiwereld mislukten ronduit.

De Republikein Giuliani wilde twee jaar geleden de strijd aanbinden met de Democrate Hillary Clinton voor de vrijkomende senaatszetel van de staat New York. Maar toen er prostaatkanker bij hem werd geconstateerd, besloot hij zijn gezondheid voor te laten gaan. Giuliani begint na zijn vertrek uit de politiek met een eigen adviesbureau. Hij wordt opgevolgd door de Republikein Michael Bloomberg, de grondlegger van het gelijknamige financiële persbureau.