Ze werd opgepakt in haar huis in Courcouronnes, ten zuiden van Parijs, op basis van een Rwandees arrestatiebevel dat was uitgevaardigd wegens beschuldigingen van genocide. Dat heeft een juridisch medewerker, die anoniem wenste te blijven, dinsdag gezegd.President Habyarimana, een Hutu, kwam in 1994 bij een vliegtuigongeluk om het leven. Velen beschouwen de dood van Habyarimana als het startpunt voor een genocide in het Afrikaanse land, die in de daaropvolgende honderd dagen ongeveer een half miljoen mensen, voornamelijk etnische Tutsi’s, maar ook gematigde Hutu’s het leven zou kosten. De slachtpartij werd geleid door radicale Hutu’s. De genocide stopte toen Tutsirebellen, onder leiding van huidig president Paul Kagame, de Hutu-extremisten in juli 1994 versloegen.

Nadat Agathe Habyarimana in 1994 met behulp van Franse troepen Rwanda wist te ontvluchten, woonde ze achtereenvolgens in Congo en Frankrijk. In 2004 vroeg Habyarimana politiek asiel aan, wat haar door Frankrijk werd geweigerd.

Bij haar pogingen een vluchtelingenstatus te krijgen, gaf Habyarimana aan dat ze geen macht had en slechts de zorg voor het huis, de tuin en kinderen op zich had genomen.

Rechters vonden deze claim echter ongeloofwaardig. Een commissie bepaalde dat, hoewel Habyarimana geen officiële regeringspost bekleedde, ze de facto autoriteit had aangaande staatszaken. De commissie zei dat de weduwe „in het hart van het regime zat” en „derhalve omging met de personen die de genocide in Rwanda voorbereidden.” De rechters baseerden hun beslissing op documenten en getuigenissen.

De Rwandese regering prees de arrestatie van Habyarimana. „We zijn aangemoedigd door deze nieuwe ontwikkelingen en door het feit dat de lange arm van de wet eindelijk zijn koers heeft bepaald”, aldus de Rwandese minister van Justitie, Tharcisse Karugarama.

De arrestatie volgde een paar dagen na een bezoek van de Franse president Nicolas Sarkozy aan Rwanda.