De aanslag op Yudhoyono zou zijn beraamd door handlangers van de mogelijk gedode terreurleider Noordin Top. Zij zouden zo wraak hebben willen nemen voor de executie van de plegers van de aanslagen in Bali in 2002. Imam Samudra, Amrozi Nurhasyim en Ali Ghufron werden in november vorig jaar doodgeschoten door een vuurpeloton.Agenten hadden zaterdag bij een inval in een huis in Bekasi, een voorstad van de hoofdstad Jakarta, ongeveer 500 kilo explosieven aangetroffen. De politie zei aanvankelijk dat de explosieven leken te zijn bedoeld voor een autobomaanslag op „een zeer specifiek doelwit", zonder toen nadere uitleg te geven. Bij de inval werden twee mensen gedood en twee opgepakt.

De politie was de militanten op het spoor gekomen na een operatie in Temanggung, een plaats op het eiland Java. Daarbij kwam Top mogelijk om het leven.