Ceku was tijdens de oorlog in Kosovo in 1999 de bevelhebber van het Kosovaarse Bevrijdingsleger (UCK). In die periode heeft hij zich volgens Servië schuldig gemaakt aan terrorisme en volkerenmoord.In 2006 werd Ceku gekozen tot premier van Kosovo, toen een autonome Servische provincie die werd bestuurd door de Verenigde Naties. Kort voor Kosovo vorig jaar de onafhankelijkheid uitriep trad hij af.

Ceku was eerder al opgepakt in Slovenië, Hongarije en Colombia, maar iedere keer werd hij vrijgelaten.