De leider van het onderzoek naar de aanslag, Made Mangku Pastika, zei maandag verder dat voor hem vast staat dat Abu Bakar Bashir - die in hechtenis zit wegens verdenking van terroristische activiteiten in 2000 - de leider is van JI. Er is volgens hem veel bewijsmateriaal tegen Bashir, dat later deze week aan de procureur-generaal zal worden overhandigd. Die gaat bekijken of Bashir wordt vervolgd.

Bashir is al veel vaker door landen en Indonesische functionarissen aangeduid als de leider van JI, maar bewijzen daarvoor waren er eigenlijk niet. Pastika zei ervan overtuigd te zijn dat de leider van JI Bashir is.

De 64-jarige Bashir werd op 20 oktober opgepakt als verdachte in een serie bomaanslagen op kerken in 2000 en een moordaanslag op Megawati Soekarnoputri voordat zij president werd. Hij weigert te praten. Bashir „blijft bij zijn standpunt dat hij weigert te worden ondervraagd en politiedocumenten over zijn aanhouding te ondertekenen.”

De Indonesische politie zoekt verder nog een Maleisische man die betrokken zou zijn bij de aanslag op Bali. Deze man, Zulkifli Marzuki, zou in februari in Bangkok hebben deelgenomen aan besprekingen ter voorbereiding van de aanslag. Bij die besprekingen waren volgens Pastika ook leiders van Jemaah Islamiyah aanwezig. Behalve Marzuki zouden nog drie Maleisiërs betrokken zijn geweest bij de voorbereidingen. Een van hen is in Maleisië opgepakt.