Ook de rest van de Kamer ging akkoord met het jaarverslag. Maar de Kamer bleef kritisch: vooral over de informatievoorziening over investeringen, de trage invoering van automatiseringsproject SPEER, het inhuren van personeel en het nieuwe financieel administratiesysteem. Het CDA maakt zich bovendien ernstig zorgen over het gebrek aan munitie.Volgens De Vries is het inderdaad moeilijk om langeafstandswapens te kopen. Daarom wordt daar bij oefeningen in Nederland „zuinig" mee omgegaan. Het heeft volgens hem geen gevolgen voor militairen die op missie zijn, in bijvoorbeeld Afghanistan. Defensie wist na twee jaar een formeel bezwaar van de Algemene Rekenkamer te voorkomen. Volgens de Rekenkamer heeft het ministerie vorig jaar stappen gezet om hardnekkige problemen met de bedrijfsvoering te voorkomen.

Volgens de PvdA is er nu licht te zien aan het eind van de tunnel. Het CDA gaf een zes. „Dat is veilig en biedt perspectief", zei Knops. Maar minister Van Middelkoop moest wel beloven dat hij met het invoeren van de nog geplande verbeteringen nog zal „doorpakken".

In 2010 kijkt de Rekenkamer of het ministerie de afgesproken verbeteringen goed heeft ingevoerd. Als dat niet zo is, dan zal de Rekenkamer het jaar daarop kijken of alsnog bezwaar wordt gemaakt.