De klager, wiens naam niet bekend is gemaakt, had meer dan twintig bekende Amerikanen, onder wie politici en kerkleiders, beschuldigd. Een verklaring van het aartsbisdom New York noemt de beschuldiging „volstrekt onjuist en beneden alle peil.” Dat berichtte The New York Times.

Egan had de man nooit ontmoet en diens naam nooit gehoord totdat de beschuldiging werd geuit. Volgens de klacht zou Egan in 1969 als priester in Chicago de man, toen nog een tiener, hebben misbruikt.

Tegen Egan loopt nog wel een ander onderzoek. Als bisschop van Bridgeport heeft hij acht priesters van wie hij wist dat ze zich aan minderjarigen hadden vergrepen, de hand boven het hoofd gehouden door hen naar een andere parochie over te plaatsen.

Egan heeft in augustus in een interview in The New York Times zijn optreden verdedigd. „In het licht van wat toen werd gedacht hebben wij de kwestie goed afgehandeld.” Dat hij de priesters had overgeplaatst, was „op advies van psychiaters.” Dat was volgens hem in die tijd de gebruikelijke gang van zaken.