Ook is gebleken dat de Nachtwacht deel uitmaakte van een reeks schuttersstukken. De overige stukken zijn door andere belangrijke Amsterdamse schilders in de zeventiende eeuw gemaakt. De stukken vormden volgens Dudok van Heel één groot geheel in de grote zaal van het clubhuis van de schutterij; de Kloveniersdoelen. Het gebouw staat nu bekend als het Doelen Hotel.De schutters, bekend als de kloveniers, lieten tussen 1640 en 1645 alle compagnieën die in de Kloveniersdoelen huisden portretteren. Omdat de Nachtwacht wat betreft kleur en samenstelling uit de toon valt bij de rest, vermoedt het Rijksmuseum dat Rembrandt zich destijds niet aan de opdracht van de kloveniers heeft gehouden.

De namen van de schutters waren al bekend omdat in 1715 een schild met namen aan het schilderij was toegevoegd. Het was alleen niet bekend wie welke naam had. Dudok van Heel onderzocht onder meer hun families, ging na welke leeftijd ze toen hadden en welke kledingstukken bij wie hoorden. Zo wist hij iedere naam aan een persoon op het schilderij te koppelen.