De scans worden al toegepast op sommige luchthavens in de Verenigde Staten en op Schiphol. Op de Amsterdamse luchthaven mogen de passagiers zelf aangeven aan welke wijze van controle zij de voorkeur geven.Volgens voorstanders maakt de full body scan het eenvoudiger om verborgen zaken te ontdekken die niet worden gevonden met metaaldetectoren, zoals vloeistoffen en plastic wapens. Tegenstanders noemen de scan „een virtuele visitatie.” Martin Schulz, leider van de socialisten in het Europarlement, noemde de scans onacceptabel. „Het is onaanvaardbaar die scanners te gebruiken, het zijn machines die je helemaal naakt zien. Het is een schending van de menselijke waardigheid”, zo zei Schulz.

De Europese Commissie heeft al beloofd dat de full body scans niet routinematig bij de controle van alle reizigers zal worden ingezet, zoals bij metaaldetectie het geval is. De Commissie wil ze alleen inzetten als een sneller alternatief voor fouilleringen en visitaties.

Toen de full body scans vorig jaar op Schiphol werden ingevoerd hadden de meeste passagiers geen bezwaar, omdat ze door de scans minder lang in de rij hoefden te staan.