In door guerrilla’s beheerste gebieden worden christenen vervolgd omdat ze de regels van de rebellen niet gehoorzamen. De meeste van de 132 gesloten kerken werden onder druk van rebellen gedwongen hun kerkdiensten te staken.De guerrilla’s sloten de kerken omdat ze het niet eens zijn met voorgangers en kerkleiders. Zij geloven dat het christendom tegen hun marxistische ideeën ingaat en dat de voorgangers het Amerikaanse „imperialisme” willen bevorderen. De rebellen verdenken de kerkleiders ervan alleen geld te vragen om kerken te bouwen, niet om armen te helpen.