Van Lohuizen was eind jaren negentig actief in het verzet tegen de aanleg van de Noord–Zuidlijn in Amsterdam. In 1997 resulteerde dit in het uitschrijven van een referendum waarmee hij de bouw van de nieuwe metrolijn probeerde tegen te houden. De tegenstanders verloren het referendum echter omdat slechts 22 procent van de kiesgerechtigden kwam opdagen.Hij was ook mede–oprichter van de lokale activistische politieke partij Amsterdam Anders/De Groenen (AA/DG). Bij de gemeenteraadsverkiezingen in 1998 behaalde de partij in de hoofdstad drie zetels. In de eerste periode was Van Lohuizen samen met Van Duijn en Kalt gemeenteraadslid voor AA/DG.