De 30-jarige verdachte, Muhammad Salameh Zufi, werd al op 9 juni aangehouden bij Rafah, in het zuiden van de Gazastrook, maar er was gewacht met de bekendmaking tot er een aanklacht tegen hem was opgesteld.Zufi, lid van de Volksverzetscomités, die zich mede verantwoordelijk stelden voor de ontvoering van Shalit, zou ook hebben deelgenomen aan een aanval op een legerpost bij de grensovergang Kerem Shalom, waarbij in 2002 vier Israëlische soldaten werden gedood. Hij wordt er door het leger bovendien van beschuldigd vanuit Gaza raketten op Israël te hebben afgeschoten.

Hoe Zufi de ontvoering van Shalit heeft vastgelegd maakte het leger niet duidelijk. De jonge korporaal werd op 25 juni 2006 gevangengenomen door radicale Palestijnen die via een tunnel vanuit Gaza Israël waren binnengekomen. Twee andere Israëlische soldaten werden gedood. Een jaar na zijn ontvoering gaven de ontvoerders een geluidsband vrij waarop Shalit zei dat zijn gezondheid na een jaar gevangenschap achteruitging.