Volgens premier Balkenende kunnen huidige ambtenaren nog een beroep doen op gewetensbezwaren. In die situatie kan een andere ambtenaar het homohuwelijk voltrekken, desnoods uit een andere gemeente. Voor de toekomst legt het kabinet de verantwoordelijkheid bij gemeenten.In het regeerakkoord is opgenomen dat als er op gemeentelijk niveau problemen ontstaan, het kabinet „initiatieven" zal nemen om de rechtszekerheid van gewetensbezwaarde ambtenaren te beschermen. Balkenende zei van de Vereniging van Nederlandse Gemeenten te hebben begrepen dat er lokaal geen problemen bekend zijn.

Bij oppositiepartijen als VVD, GroenLinks en D66 bestaat wrevel over de afspraken in het regeerakkoord. Zij vinden dat ambtenaren niet mogen weigeren een homohuwelijk te sluiten.