Onderzoeksrechter Leonidas Zervobeakos beschuldigde Giotopoulos van moord met voorbedachten rade in Athene op de Britse militaire attaché Stephen Saunders in 2000 en de Griekse scheepsmagnaat Costas Peratikos drie jaar daarvoor. De aanklacht werd nog aangevuld met het aanzetten tot een serie andere moorden, waaronder die op twee Turkse diplomaten in 1994 en 1991, en pogingen tot moord op twee Grieken.

De advocaat van Savvas Xiros, een andere verdachte van lidmaatschap van 17 November, heeft bekend dat zijn cliënt was betrokken bij de moord op Saunders, maar zei daarbij dat Giotopoulos er ook mee te maken had. De verklaringen van Xiros worden gestaafd door de meeste van de overige veertien verdachten die zijn gearresteerd. Zij hebben benadrukt dat Giotopoulos de spil was in de organisatie.

Volgens een van de arrestanten, Pavlos Serifis, was Giotopoulos de onbetwiste leider van 17 November en voerde hij persoonlijk de moord uit op CIA-topman Richard Welch in 1975 in Athene. Voor zover bekend was dat de eerste van de 23 moorden waarvan de organisatie wordt verdacht. De politie denkt dat Serifis daar ook bij betrokken was.

17 November pleegde 27 jaar lang moorden zonder dat de Griekse politie er vat op kreeg. Tot die begin juli toevallig stuitte op Xiros. Die werd aangehouden nadat hij gewond was geraakt doordat de bom die hij bij zich had te vroeg afging. Daarop volgden nog veertien arrestaties.

Giotopoulos ontkent iets te maken te hebben met de organisatie, die genoemd is naar de datum van een studentenopstand in 1973 tegen het militaire regime dat Griekenland bestuurde van 1967 tot 1974.