Volgens een ontwerpadvies, dat donderdag wordt gepresenteerd, moet het aantal profielen in de vernieuwde Tweede Fase worden teruggebracht naar twee: een natuurprofiel en een maatschappijprofiel. Nu zijn er nog vier profielen, twee met nadruk op exacte vakken en twee waarin maatschappijvakken de boventoon voeren.Van der Hoeven: „Het is wat mij betreft nadrukkelijk niet de bedoeling nu al weer te praten over een nieuwe, ingrijpende stelselwijziging. Dat is bepaald niet bevorderlijk voor de rust in onderwijsland".

Volgens het voorstel kunnen binnen de twee profielen verschillende richtingen komen die voorbereiden op specifieke opleidingen op hogescholen en universiteiten. Van het natuurprofiel zouden biologie, natuurkunde en scheikunde de kern moeten gaan vormen. Binnen het maatschappijprofiel komen in het advies drie richtingen voor het vwo en twee voor de havo. Het advies heeft een voorlopig karakter, de definitieve versie volgt in augustus 2007.