Blue Grass is een klein vliegveld met twee startbanen. Het toestel van Comair nam zondag de korte startbaan, die nooit voor passagiersvliegtuigen wordt gebruikt. De baan is 1160 meter lang, terwijl het toestel van Comair, een tweemotorige CRJ-100, ten minste 1660 meter nodig heeft om van de grond te komen.„De piloot heeft de baan genomen die nooit voor zulke toestellen wordt gebruikt. Wij zullen proberen erachter te komen hoe dat kon gebeuren”, aldus Debbie Hersman van de National Transportation Safety Board (NTSB). In samenwerking met de Federal Aviation Administration (FAA) heeft de NTSB onmiddellijk een onderzoek ingesteld. De zwarte dozen van het toestel met vluchtgegevens en cockpitgesprekken zijn teruggevonden.

Met het ongeluk in Kentucky is er een eind gekomen aan een periode van relatieve veiligheid in de Amerikaanse luchtvaart. Het laatste grote ongeluk gebeurde op 12 november 2001 bij New York. Een toestel van American Airlines stortte toen neer op de wijk Queens. Daarbij kwamen 265 mensen om, inclusief 5 bewoners van Queens. De laatste keer dat een piloot zich in de startbaan vergiste was -voor zover bekend- op 31 oktober 2000. Een toestel van Singapore Airlines nam toen op het vliegveld Tsjang Kai Sjek van Taiwan de verkeerde baan. Die vergissing kostte 83 mensen het leven.

FAA-woordvoerster Laura Brown benadrukte zondag dat niets erop wijst dat er enige vorm van terrorisme in het spel was. Het toestel was op weg naar Atlanta in Georgia. „Het vliegtuig had aan het begin van z’n vlucht veel brandstof aan boord; dat veroorzaakte na de crash een enorme brand waardoor het reddingswerk aanzienlijk werd bemoeilijkt”, aldus Brown. President Bush werd later op de dag over het ongeluk geïnformeerd. Volgens Witte Huiswoordvoerster Dana Perino heeft de president „geschokt” regeageerd op het nieuws.