1999:November: Bij een botsing tussen een sneltrein en een intercity iets ten zuiden van het station Dordrecht raken in november 1999 drie passagiers lichtgewond.

2001:

Januari: Enkele treinpassagiers raken lichtgewond als op het station van Alkmaar twee treinen met elkaar in botsing komen.

Mei: Een intercity rijdt vlakbij het station van Zwolle een goederentrein in de flank aan. Bij het ongeval raken zeven mensen lichtgewond.

Juni: Op het emplacement van station Utrecht Centraal botsen twee stoptreinen op elkaar. Drie mensen raken gewond.

November: Een intercity ontspoort op het station in Enschede nadat het tegen een stookblok was gebotst. In de trein, waarin vijftien passagiers zaten, vallen vier gewonden.

2003:

Februari: Zes reizigers raken gewond door een ongeval met een trein bij Breda. De reizigerstrein wordt geraakt door een openstaande laadklep van een tegemoetkomende goederentrein met houtsnippers.

Maart: De machinist van een passagierstrein komt om het leven nadat een goederentrein en de passagierstrein op een wissel frontaal botsten. Zeven anderen raken bij het ongeval nabij Roermond ernstig gewond. Dertig mensen hebben lichte verwondingen.

November: In Alphen aan den Rijn botsen een goederentrein en een lijnbus. Een medewerker van Railion komt om het leven. Een deel van de 25 inzittenden van de bus raakt gewond.

2004:

Mei: Twintig reizigers raken gewond, van wie twee ernstig, bij een ongeluk tussen twee treinen bij Amsterdam Centraal Station. Een volle intercitytrein botste tegen een rangerende lege goederentrein.

2005

November: Een botsing bij Wijhe tussen een trein en een vrachtwagen met houtsnippers kost het leven aan de vrachtwagenchauffeur. De machinist raakt door het ongeval ernstig gewond. Dertig treinpassagiers raken lichtgewond.

2006

Juni: Op het station van Maastricht botst een binnenkomende trein met passagiers op een lege trein. Ongeveer twintig tot 25 personen raken gewond.