Alleen unaniem had de twaalfkoppige jury Moussaoui de doodstraf kunnen opleggen. In plaats daarvan vond de jury dat hij levenslang moet worden opgesloten zonder kans op vervroegde vrijlating.De aanklagers hadden gepleit voor executie omdat er „geen plaats op deze goede aarde" voor Moussaoui zou zijn. Hij hield tegen de politie informatie achter die de aanslagen had kunnen voorkomen.

De verdediging stelde dat Moussaoui geen martelaar mocht worden door hem te executeren. De advocaten hadden ook gewezen op de moeilijke jeugd van Moussaoui in Frankrijk, waar hij met racistisch geweld zou zijn geconfronteerd.