De speciale commissie schrijft onder meer dat het Indonesische leger de bevolking uithongerde en seksueel misbruikte. De bezetting heeft volgens de onderzoekers aan mogelijk 183.000 mensen het leven gekost.President Gusmao, tijdens de bezetting een van de leiders van het verzet, heeft het rapport tot nog toe niet openbaar willen maken uit angst dat de relatie met het machtige buurland onder spanning komt te staan. Mensenrechtengroeperingen hebben de VN opgeroepen het rapport alsnog openbaar te maken.

Slachtoffers en daders worden in het 2500 pagina’s tellende werk met name genoemd. Het stuk beschrijft onder meer executies, martelingen en gedwongen verhuizingen. Ook roept het op om meer schuldigen te vervolgen, aldus media die wel inzage hebben gehad in delen van het rapport.