Na de bekendmaking van de voorlopige uitslag donderdag trokken aanhangers van beide kandidaten de straat op in de hoofdstad Bissau en gooiden zij stenen en flessen naar elkaar. De oproerpolitie probeerde de vechtende betogers uiteen te drijven met traangas. Het was onduidelijk of er gewonden zijn gevallen bij de rellen.

Sanha, die een interim–regering in Guinnee–Bissau leidde na het einde van de burgeroorlog van 1998–99, verwierp de uitslag en zei dat er op grote schaal fraude was gepleegd tijdens de verkiezingen. Hij riep zijn aanhang echter op zich rustig te houden en beloofde op vreedzame wijze voor zijn rechten te strijden. Volgens de wet moet er binnen tien dagen een officiële uitslag zijn.

De kiezers hopen dat de nieuwe president, de eerste sinds de coup van 2003, het land na jaren van dictatuur, oorlog en staatsgrepen, rust en welvaart kan brengen. Vieira kwam in 1980 aan de macht in Guinnee–Bissau na een militaire staatsgreep. Hij regeerde negentien jaar, maar werd in de burgeroorlog gedwongen af te treden. In de eerste ronde van de presidentsverkiezingen werd hij tweede met 29 procent van de stemmen, achter Sanha die 35 procent behaalde. Vieira werd in de tweede ronde echter gesteund door Kumba Yala, een oud–president die in de coup van 2003 werd gedwongen af te treden. Kumba Yala viel na de eerste ronde van de verkiezingen af.