Het ongeluk bij het plaatsje Ghotki, ongeveer 600 kilometer ten noordoosten van Karachi, gebeurde toen een passagierstrein rond vier uur in de ochtend achter op een stilstaande passagierstrein botste, waarna een trein uit de tegenovergestelde richting op de ontspoorde rijtuigen inreed. Abdul Wahab Awan, algemeen manager van Pakistan Railways, zei dat de machinist van de eerste trein een sein had gemist. Javed Iqbal Cheema, nationaal crisismanager van het ministerie van Binnenlandse Zaken, sloot sabotage uit. President Pervez Musharraf betuigde zijn medeleven met de slachtoffers of hun nabestaanden en beloofde dat iedereen die nalatig is geweest, zal worden gestraft. Hij zei dat ten minste 135 mensen zwaargewond zijn.

Aan boord van de drie treinen bevonden zich volgens Chaudhry Nazir Ahmed van de spoorwegen in Ghotki ongeveer 1000 passagiers. De trein van Lahore naar Quetta was met een technisch mankement in Ghotki gestopt toen de trein van Lahore naar Karachi erop inreed. „Wij lagen te slapen en werden door een enorme klap wakker”, zei een 22-jarige vrouw. Drie rijtuigen belandden door de klap op het andere spoor, waar even later de trein van Karachi naar Rawalpindi passeerde.

Het Pakistaanse spoorwegstelsel is verouderd en vooral Ghotki is een gevaarlijk knooppunt, waar zich in de afgelopen jaren veel ongelukken hebben voorgedaan. Op 8 juni 1991 vielen er meer dan honderd doden toen een personentrein op een stilstaande goederentrein botste. In december 1989 vielen 400 doden bij een treinbotsing in Sangi, op 60 kilometer van Ghotki.